機(jī)長和第二機(jī)長的主要區(qū)別在于機(jī)長肩負(fù)著更多的責(zé)任和權(quán)力。機(jī)長除了駕駛飛機(jī)外，還是飛行途中的管理者。而第二機(jī)長往往是機(jī)長的輔助者，在機(jī)長有特殊情況時(shí)，第二機(jī)長要負(fù)責(zé)駕駛飛機(jī)。
機(jī)長在飛行中最高的法律地位和至高無上的權(quán)力，航空活動(dòng)中機(jī)長對(duì)航空器和旅客的安全負(fù)有直接的也是最終的責(zé)任。
在駕駛艙里機(jī)長對(duì)飛機(jī)的安全有最后決定權(quán)，機(jī)長有權(quán)更正副駕駛的任何非正常操作或行為，第二機(jī)長不得指揮機(jī)長，但及時(shí)的提醒是第二機(jī)長的職責(zé)之一。
一般情況下，在我國，從一個(gè)完成基礎(chǔ)飛行培訓(xùn)的學(xué)員成長為正式的機(jī)長，這期間要經(jīng)歷大概八個(gè)階段，即跟機(jī)觀察員、全程右座、第一階段副駕駛、第二階段副駕駛、第三階段副駕駛、第四階段副駕駛、左座副駕駛，然后才可以成為機(jī)長。