優(yōu)選答案按綜合排名來看，北大醫(yī)學院全國第二，復旦醫(yī)學院（下用上醫(yī)代替）第三，交大醫(yī)學院（下用上二醫(yī)代替）第四?？既‰y度來看，在全國范圍也是北醫(yī)最難，其次上醫(yī)，再次上二醫(yī)。
上二醫(yī)雖然是交大的醫(yī)學院，但05年并校時上二醫(yī)領導要求與交大分開招生，財務、人事獨立，類似北醫(yī)。而上醫(yī)作為復旦醫(yī)學院，并入復旦共同招生，因此最低分數線即為復旦大學分數線。因此在除上海外的全國其他地區(qū)，上醫(yī)分數線高于北醫(yī)，上二醫(yī)最低。在上海為上醫(yī)較高，其次上二醫(yī)，北醫(yī)在上海不招生。
三個醫(yī)學院都位列全國最頂尖的四大醫(yī)學院（武書連榜A++級），教學質量孰優(yōu)孰劣不好妄言，不過各有側重。在臨床醫(yī)學方面，北醫(yī)最好（全國第二），上二醫(yī)其次，上醫(yī)再次。基礎醫(yī)學方面，上醫(yī)最好（全國第一），北醫(yī)其次，上二醫(yī)再次。預防醫(yī)學、醫(yī)學檢驗學、營養(yǎng)學之類科目太小，暫且不提。護理學方面無法比較，北醫(yī)和上醫(yī)兼有一本高護和?？谱o理，上二醫(yī)只有一本高護。

在發(fā)展趨勢上，隨著全國醫(yī)學院并校逐漸完成，徹底被吞吃的醫(yī)學院（比如上醫(yī)、湘雅等）失去了獨立的財務和人事權，其發(fā)展趨勢將隨其母校發(fā)展而定，而在國內大學的發(fā)展趨勢上，無疑理工科學校暫時是發(fā)展最為迅猛的。關于上醫(yī)的諸多傳聞由于尚待證實，這里我就不提了。對于獨立性比較強的醫(yī)學院（如上二醫(yī)、北醫(yī)），其發(fā)展趨勢將綜合母校與自身的情況。鑒于近10年里上交極為迅猛的發(fā)展速度及上交對上二醫(yī)的重視程度（連續(xù)3年開學典禮新生代表發(fā)言者都來自醫(yī)學院），上二醫(yī)的前景看好。
其實說了這么多，提問者為什么不選擇協(xié)和？也就是清華的醫(yī)學院，那絕對是中國醫(yī)科的王者，當然，考取難度也是最高的。